Apabila virus telah dihantar, terdapat fasa di mana orang yang dijangkiti tidak menunjukkan sebarang tanda. Ini dipanggil fasa senyap, dan yang terakhir berlangsung antara 2 dan 21 hari. Dalam tempoh ini, adalah mustahil untuk mengesan virus dalam darah kerana ia terlalu rendah, dan orang itu tidak boleh dirawat.

Kemudian gejala utama pertama penyakit virus Ebola muncul. Lima gejala yang paling jelas ialah:

• Kemunculan tiba-tiba demam yang kuat, disertai dengan menggigil;
• Cirit-birit;
• muntah;
• Keletihan yang sangat kuat;
• Kehilangan selera makan yang ketara (anoreksia).

Tanda-tanda lain mungkin ada:

• sakit kepala;
• sakit otot;
• sakit sendi;
• kelemahan;
• kerengsaan tekak;
• sakit perut;

Dan dalam kes pemburukan:

• batuk;
• ruam;
• sakit dada;
• Mata merah;
• kegagalan buah pinggang dan hepatik;
• pendarahan dalaman dan luaran.